在一個絢麗多彩的動物城市里，生活著各式各樣的動物們。這里是一個和諧的社會，各種動物共存共榮。經過了第一部的精彩故事后，《瘋狂動物城2》的回來，讓所有粉絲期待滿滿。故事繼續圍繞著勇敢的兔警官朱迪·霍普斯和機智的狐貍尼克·王爾德展開，新的冒險即將開始。
朱迪與尼克已經成為了無話不談的好朋友，朱迪在動物城的警局也逐漸嶄露頭角，成為了一名優秀的警官。她的努力和勇氣贏得了同事們的尊重，而尼克則在她的影響下，決定進一步發展自己的事業，開始參與一些社會公益活動，幫助那些需要幫助的動物們。
然而，和平的時光沒有持續太久。一場意想不到的事件打破了城市的寧靜。動物城突然發生了一系列失蹤案件，各種動物不翼而飛，警局陷入了巨大的壓力。不安的氣氛籠罩著整個城市，動物們緊張不已，紛紛向警方求助。朱迪和尼克意識到，這是一個攸關全城動物安全的大問題，他們決定聯手調查。
兩位主角開始在城中奔波，逐漸找到了一些線索。調查的過程中，他們碰到了形形色色的動物，從古靈精怪的小松鼠到嚴肅認真的大象，他們都在為這件事感到擔憂。朱迪用她的耐心和細致，傾聽每一個動物的心聲，而尼克則憑借著他獨特的直覺，像偵探一樣分析每一個細節。
隨著調查的深入，他們發現失蹤案件的背后似乎隱藏著一個更大的陰謀。許多動物的失蹤，似乎與某個神秘組織有關，這個組織企圖在背后操控動物城的政局。而這個組織的首領，名叫“暗影狼”，是一個曾經生活在動物城的異常聰明的狼。傳言他因為過去的陰暗交易而被驅逐出城，現在他回來了，并且通過恐嚇與操控，制造分歧和不安，以便讓更多的動物跟隨他。
朱迪與尼克決定不再單打獨斗，他們聯系了小組合作，召集了其他的朋友來共同對抗這一黑暗勢力。格雷夫大象、弗爾滋兔子、克里夫獅子等動物都加入到了調查中，為了整個動物城的安全，他們誓言要揭開這個神秘組織的真相。
隨著行動的展開，暗影狼開始對朱迪和尼克下手，他派出手下對他們進行威脅，然而兩位主角并沒有退縮，反而更加堅定了自己的決心。在數次險象環生的追逐中，他們終于潛入了暗影狼的老巢，發現了失蹤動物的囚籠，以及暗影狼與手下之間的密謀。
在一次驚心動魄的 showdown 中，朱迪與尼克將暗影狼的陰謀曝光，帶領著各路動物團結一致，共同抵抗這一威脅。動物城的居民們意識到，在這場斗爭中，唯有團結才能戰勝邪惡。經過一番激烈的沖突，暗影狼最終被捕，而失蹤的動物們也相繼得以營救。
在事件平息后，動物城逐漸恢復了往日的安寧，朱迪與尼克的友誼更是愈加深厚。在經歷了如此艱難的考驗后，他們明白，未來的道路上依然充滿挑戰，但只要他們心手相連，就一定能克服一切困難。
故事最后，朱迪與尼克一同站在動物城的最高點，俯瞰著這座充滿生機與希望的城市。陽光灑在他們的身上，未來的道路如同那道光輝，閃爍著希望的光芒。即使前路未知，朱迪與尼克知道，只要彼此相伴，就能冒險到底，成就無畏的傳奇。
《瘋狂動物城2》不僅是一部充滿冒險與笑聲的動畫，更是在告訴我們團結、勇氣與友誼的重要性。無論面對多么艱難的挑戰，正義終將戰勝邪惡，愛與理解能夠克服一切障礙。希望每一位觀眾都能從中感悟到積極向上的力量，與動物城的角色們一同，共創美好未來。