在一個虛構的世界中，有一個名叫Hope's Peak Academy（希望峰學院）的學校，這是一所培養擁有卓越才能的學生的地方。然而，這所學校并不是普通的學府，而是一個充滿陰謀與密謀的地方。每年，學校會挑選出一些被稱為“超高校級”的學生，賦予他們特殊的才能。但在這次的故事中，命運的齒輪開始轉動，一場無法預料的悲劇即將來臨。
故事的主角是一個名叫赤松有華的少女，她是一位超高校級的鋼琴家。雖然她的天賦在音樂上無人能敵，但她總是感到一種無形的孤獨。進入希望峰學院后，她期待著能結識到志同道合的朋友，然而，學校的氣氛卻讓她感到幾分不安。
開學的第一天，赤松踏入學校，心中充滿了期待。走進教室，四周的同學們都在討論著各自的才能。就在這一刻，教室的門突然關閉，整個空間瞬間陷入了恐懼。在黑暗的氣氛中，一個身穿熊服的生物——“莫諾庫馬”出現了，宣布了一場殘酷的游戲：“你們將在這里生活，想要逃出這個地方，只有一個辦法，那就是殺死其他人而不被發現。”
赤松感到一陣恐慌，雖然平時她是個樂觀的女孩，但面對如此殘酷的威脅，她的內心開始動搖。在隨后的日子里，學員們的關系開始變得微妙，信任與背叛交織。有人試圖團結大家，有人卻逐漸陷入了絕望，甚至開始策劃著殺人。
在震撼與恐懼中，赤松看到了一些同學的變化。其中一個名叫日向創的少年，讓她印象深刻。滿身自信，似乎對所有的事情都有著清晰的見解，但眼神中又透露出一絲不可捉摸的憂郁。赤松逐漸與他成為朋友，彼此分享著對未來的憧憬和對這場游戲的恐懼。
但不久后，校園里發生了一起悲劇。一名同學在宿舍被發現死于非命，周圍留下了可疑的證據。學校立刻進入了審理環節，所有人都被要求參加這場死者的審判。赤松和日向決定要揭開真相，他們深知這場審判不僅關乎正義，更關乎每一個人的生存。
隨著調查的深入，赤松發現了一些不為人知的秘密。原來，每位同學的過往都與這場游戲有著千絲萬縷的聯系，甚至包含一些令人震驚的陰暗故事。她理解到，每個同學都不是簡單的角色，他們的經歷與心理素質正成為這場生存游戲中的重要因素。
在檢驗證據的過程中，赤松與日向的關系不斷加深，他們形成了一個無形的信念，希望能憑借彼此的力量打破這個詭異的循環。赤松通過音樂撫慰了自己的情緒，同時也幫助其他同學緩解緊張的氣氛，逐漸在這個充滿絕望的環境中點燃了一線希望。
然而，隨著調查真相的接近，他們發現惡徒就在身邊。懷疑與猜忌越來越深入，曾經的友情與信任在危機中瀕臨崩潰。赤松有時會感到無力，難以忍受這種情感的糾葛與攻略的游戲。她開始質疑自己，是否真的能在一片混亂中找到真相，拯救每一個同學。
最終，審判的日子到來了。赤松站在法庭面前，聚集了所有的同學。她感受到每個人的目光中都滲透著恐懼與期待。她回憶起他們一起經歷的點點滴滴，心中的青澀與勇氣交織在一起。她決定站出來，講述她的發現，以及她對這個殘酷游戲的獨到看法。
“我們不是只為了生存而相互殺戮，我們更應當找到真正的敵人，是這個制度，是這個被操控的游戲！我們始終是一個團體，我們要一起打破這個循環！”
她的激情感染了在場的同學們，逐漸喚醒了他們沉睡已久的勇氣。赤松呼吁大家團結一致，在絕望中尋找希望。他們需要面對的，不是彼此的仇恨，而是共同的敵人。
經過激烈的討論和情感的碰撞，真相終于大白于天下。正是這個操控他們行動的莫諾庫馬，利用他們的恐懼和心理，制造出了一場場悲劇。最終，在赤松與同學們的努力下，他們打破了莫諾庫馬的桎梏，擺脫了這個殘酷的游戲。
雖然后來的生活依然充滿挑戰，但赤松有華、日向創以及其他同學之間建立的深厚友情，讓彼此都明白了一個道理：真正的絕望并不可怕，最重要的是在黑暗中找到彼此的光亮，攜手并肩去追尋希望。